定制 dPCR引物及
探针
用于罗氏 Digital LightCycler® System
通过与罗氏合作,我们很高兴为罗氏 Digital LightCycler® System 提供定制引物、标准(3’-淬灭)探针、内淬灭探针和双淬灭(内淬灭和3’-淬灭)探针。
数字PCR是终点PCR方法,用于绝对定量和针对相似多数序列背景所分析的少数序列,例如体细胞突变的定量。 罗氏Digital LightCycler® System (图 1) 支持无细胞DNA/肿瘤学、基因表达/绝对定量和拷贝数量变 异/NIPT应用,分别具有高灵敏度(20,000个分区)、通用(28,000个分区)和高分辨率(100,000个分区)设置。

图 1.从左至右: 分析仪和分区引擎系统亮点包括:具有6个光学通道的分析仪允许进行多重检测;3种耗材配置可以满足不同的临床应用;基因5X DNA预混液优化提供高特异性和信号分离;基因5X RNA预混液优化获取显著的有效RT活性;样本追踪和自动数据分析能力简化了工作流;每批最高可以检测96个样本(1-12板),每批用时2-4小时
如下性能参数表明,我们的引物和探针经过广泛测试,证明完全适配该数字PCR平台。
产品优势
- 引物
- 取您所需:各种规模、纯化方法等
- 改善锁核酸杂交特异性
- 标准探针
- 序列特异性设计简单
- 广泛的报告/淬灭基团组合
- 内淬灭探针
- 设计更长的探针
- 广泛的报告/淬灭基团组合
- 双淬灭探针
- 设计更长的探针
- 信噪比好
- 更适合检测挑战性靶标
如果您的需要不同于在此所给的通用规格,请发送邮件至 dnaoligos@merckgroup.com进行咨询。
性能参数
罗氏研发部门在 Digital LightCycler® System 上测试了标准探针、内淬灭探针和双淬灭探针检测。参数如下:
- 人类DNA靶标 (图 2 和 3)
- EIF5B (内含子 1)
- 扩增子:112 bp
- 正向引物GGCCGATAAATTTTTGGAAATG
- 反向引物GGAGTATCCCCAAAGGCATCT
- 标准探针[6FAM]TTCAGCCTTCTCTTCTCATGCAGTTGTCAG[BHQ1]
- 内淬灭探针[6FAM]TTCAGCCTT[BHQ2]CTCTTCTCATGCAGTTGTCAG
- 双淬灭探针[6FAM]TTCAGCCTT[BHQ2]CTCTTCTCATGCAGTTGTCAG[BHQ1]
- HER2 (外显子 7)
- 扩增子:112 bp
- 正向引物CTCATCGCTCACAACCAAGT
- 反向引物GGTCTCCATTGTCTAGCACG
- 标准探针[HEX]ACCCAGCTCTTTGAGGACAACTATGC[BHQ1]
- 内淬灭探针[HEX]ACCCAGCTC[BHQ2]TTTGAGGACAACTATGC
- 双淬灭探针[HEX]ACCCAGCTC[BHQ2]TTTGAGGACAACTATGC[BHQ1]
- 实验设置
- ELISA 测定
- Digital LightCycler® DNA 预混液
- 高分辨率板
- HCT-116 gDNA 模板, ~1 cpp处
- 900 nM / 250 nM & 450 nM / 125 nM 引物 / 探针浓度
- 在每种条件下,设置一个阴性对照组,平行进行两次复制
- 1D荧光散点分析
- EIF5B (内含子 1)
- 人类RNA靶标 (图 4)
- HER2 (外显子 7)
- 扩增子长度、引物和探针与上述HER2 DNA检测全部相同。
- R4Q5 [DCK] (外显子 3)
- 扩增子:122 bp
- 正向引物CTCAGAAAAATGGTGGGAATGTT
- 反向引物GCCATTCAGAGAGGCAAGCT
- 标准探针[Cyanine5]CCTTCCAAACATATGCCTGTCTCAGTCGA[BHQ3]
- 内淬灭探针[Cyanine5]CCTTCCAAA[BHQ2]CATATGCCTGTCTCAGTCGA
- 双淬灭探针[Cyanine5]CCTTCCAAA[BHQ2]CATATGCCTGTCTCAGTCGA[BHQ3]
- 实验设置
- ELISA 测定
- Digital LightCycler® RNA 预混液
- 高分辨率板
- 50 ng Clontech qPCR Human Reference Total RNA
- 450 nM / 125 nM 引物 / 探针浓度
- 在每种条件下,设置一个阴性对照组,平行进行两次技术复制
- 1D荧光散点分析
- HER2 (外显子 7)

图 2.EIF5B DNA靶标检测的1D散点A) 900 nM 引物和 250 nM 探针。B) 450 nM 引物和 125 nM 探针。对于A和B,从左至右:对照、标准探针检测、内淬灭探针检测和双淬灭探针检测每个检测仅显示一个复制。

图 3.HER2 DNA靶标检测的1D散点A) 900 nM 引物和 250 nM 探针。B) 450 nM 引物和 125 nM 探针。对于A和B,从左至右:对照、标准探针检测、内淬灭探针检测和双淬灭探针检测每个检测仅显示一个复制。

图 4.HER2 RNA靶标检测的1D散点A) HER2检测、 450 nM 引物和 125 nM 探针。B) R4Q5 (DCK) 检测、450 nM 引物和 125 nM 探针。对于A和B,从左至右:对照、标准探针检测、内淬灭探针检测和双淬灭探针检测每个检测仅显示一个复制。
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