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NGS 文库制备

NGS 文库制备

文库制备是新一代测序的第一步。 在对 DNA 或 RNA 样品进行测序之前,必须使用连接或标记 方法对核酸进行分离、片段化、末端修复以及与适配体共价连接。准备充分的 NGS 文库的复杂性应全面准确地反映样本的复杂性,但也会反映文库制备过程中引入的任何偏差。为下一代测序制备 DNA 或 RNA 文库的一个关键目标是最大限度地提高复杂性,同时减少对 DNA 或 RNA 文库的破坏;是最大限度地提高复杂性,同时减少 PCR 或其他扩增引起的偏差,因为由此产生的文库的质量会对 NGS 结果产生重大影响。

我们提供一系列 NGS 文库制备工具,旨在简化工作流程,促进高质量 DNA 或 RNA 文库的制备,这些文库能准确反映样本的复杂性,同时减少全基因组测序 (WGS)、全转录组分析 (WTA)、总 RNA 测序以及 miRNA 和小 RNA 测序应用的偏差。


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基因组 DNA 提取试剂盒

为制备 DNA 文库, ;需要从细胞、组织或其他类型的样本中提取高分子量的基因组 DNA。纯化的基因组 DNA 应具有最小的剪切力和生物及化学杂质,以便在随后的扩增或测序反应中发挥最佳性能。   

火猴™/火花™高分子量 DNA 提取试剂盒可分离出高纯度基因组 DNA,并将剪切力和低分子量核酸杂质降至最低。

  • 火猴™ 是一种标准的旋柱工艺,可在 1 小时内从细菌或哺乳动物细胞中提取平均链长为 100kb 的高分子量 DNA。
  • Fire Flower™ 是一种标准的旋柱工艺,可在 15 分钟内从任何 样本来源中对提取的 DNA 进行大小选择。Fire Flower™ 可将整体平均链长增加 30%,同时耗尽高达 30kb 的 DNA 片段 

全基因组扩增试剂盒

DNA 序列分析通常受到可用样本量少或提取率低的限制。当可获得的起始材料有限时,可以使用扩增技术来增加起始 DNA 的数量。全基因组扩增(WGA)可用于预扩增完整和高度片段化的 DNA 样品,以便输入 NGS 工作流程。

SeqPlex-I WGA 试剂盒可以扩增少量 DNA 或降解 DNA 或高度片段 DNA,以便直接输入到 Illumina® 下一代测序(NGS)流式细胞中。

  • 可对少至 100 pg 的 DNA 进行测序
  • 加强的引物可实现全基因组测序。增强型引物可实现完整的基因组覆盖、最小的序列偏差和扩增子大小,是下一代测序 (NGS) 的理想选择
  • 成本效益高:无需额外的 NGS 文库预处理步骤
  • 与 Illumina® 下一代测序兼容

The SeqPlex ;用于全基因组扩增的增强型 DNA 扩增试剂盒旨在促进从极少量或降解/高度片段化的 DNA 中进行下一代测序。该试剂盒可集成到 Illumina®、 SOLiD™ 或 454 测序工作流程中。

  • 随机引物技术可扩增片段 DNA,如 ChIP 或 FFPE
  • 便于从低至 100 pg 的片段进行测序。nbsp;of ChIP DNA
  • 增强型引物可实现全基因组覆盖、最小序列偏差 和引物去除
  • 兼容Illumina®

Whole-Transcriptome-Amplification-Kits

制备 NGS 文库的主要目标 ;为 RNA-Seq 准备 NGS 文库的主要目标是最大限度地提高转录组文库的复杂性,以充分代表起始序列库,同时减少偏差。用于高通量基因表达谱分析和转录组分析的 RNA-Seq 通常面临起始 RNA 数量少的挑战。全转录组扩增(WTA)可用于从少量 RNA 中产生足够数量的测序目标,但需要高保真度;需要高保真的转录本复制,同时不丢失或扭曲特定的 mRNA,以减少文库偏差。

SeqPlex-I WTA 套件允许扩增少量反转录 RNA 或降解 RNA,以便直接输入到 Illumina® 下一代测序 (NGS) 流式细胞中。使用随机引物技术,可轻松扩增来自各种来源(包括 FFPE 和 RIP)的片段或完整 RNA。

  • 半退化文库引物设计确保更全面的转录组覆盖和高效的引物 
  • 步骤更少:测序前无需对 cDNA 进行片段化处理
  • 高效:在 8 小时或更短时间内扩增 ds-cDNA
  • 成本效益高:不再需要额外的 NGS 文库预处理步骤
  • 与 Illumina® 下一代测序兼容
  • The ;SeqPlex RNA扩增试剂盒 用于全转录组扩增(WTA),旨在促进从少量或降解/高度片段化的RNA(例如:RNA)中进行下一代测序(NGS)。例如,来自福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本的 RNA)。

    • 随机引物技术可扩增来自各种来源(包括 FFPE 和 RIP)的少量片段或完整 RNA。
    • 半退化文库引物设计可实现更全面的转录组覆盖和高效引物。
    • 8小时或更短时间内扩增ds-cDNA。
    • 兼容除Pacific Bioscience以外的所有新一代测序平台。

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